Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CDK6Q00534 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms