Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ASIC1P78348 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ASIC1P78348 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms