Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTBP60709 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTBP60709 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTBP60709 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTBP60709 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTBP60709 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTBP60709 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTBP60709 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTBP60709 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTBP60709 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTBP60709 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTBP60709 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTBP60709 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTBP60709 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ACTBP60709 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTBP60709 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTBP60709 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTBP60709 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTBP60709 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTBP60709 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTBP60709 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTBP60709 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTBP60709 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTBP60709 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTBP60709 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTBP60709 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTBP60709 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTBP60709 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTBP60709 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTBP60709 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTBP60709 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTBP60709 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTBP60709 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTBP60709 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTBP60709 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTBP60709 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTBP60709 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTBP60709 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTBP60709 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTBP60709 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTBP60709 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTBP60709 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTBP60709 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTBP60709 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTBP60709 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ACTBP60709 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTBP60709 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTBP60709 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTBP60709 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTBP60709 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTBP60709 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTBP60709 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTBP60709 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTBP60709 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTBP60709 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTBP60709 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTBP60709 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTBP60709 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTBP60709 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTBP60709 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ACTBP60709 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTBP60709 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTBP60709 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTBP60709 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTBP60709 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTBP60709 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTBP60709 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTBP60709 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTBP60709 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTBP60709 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTBP60709 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTBP60709 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTBP60709 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTBP60709 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTBP60709 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTBP60709 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTBP60709 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTBP60709 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTBP60709 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTBP60709 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTBP60709 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTBP60709 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTBP60709 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTBP60709 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTBP60709 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ACTBP60709 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTBP60709 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTBP60709 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTBP60709 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTBP60709 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTBP60709 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTBP60709 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTBP60709 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTBP60709 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTBP60709 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTBP60709 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTBP60709 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTBP60709 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTBP60709 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ACTBP60709 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms