Protein–RNA interactions for Protein: P56856

CLDN18, Claudin-18, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN18P56856 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN18P56856 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN18P56856 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN18P56856 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN18P56856 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN18P56856 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN18P56856 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN18P56856 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN18P56856 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLDN18P56856 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN18P56856 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN18P56856 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN18P56856 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN18P56856 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN18P56856 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN18P56856 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN18P56856 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN18P56856 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN18P56856 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN18P56856 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN18P56856 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN18P56856 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN18P56856 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN18P56856 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN18P56856 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN18P56856 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN18P56856 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN18P56856 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN18P56856 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN18P56856 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN18P56856 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN18P56856 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLDN18P56856 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN18P56856 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN18P56856 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN18P56856 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN18P56856 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN18P56856 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN18P56856 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN18P56856 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN18P56856 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN18P56856 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN18P56856 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN18P56856 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN18P56856 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN18P56856 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN18P56856 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN18P56856 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN18P56856 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN18P56856 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN18P56856 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN18P56856 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN18P56856 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN18P56856 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLDN18P56856 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CLDN18P56856 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN18P56856 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN18P56856 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN18P56856 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN18P56856 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN18P56856 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN18P56856 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN18P56856 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN18P56856 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN18P56856 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN18P56856 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN18P56856 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN18P56856 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN18P56856 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN18P56856 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN18P56856 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN18P56856 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN18P56856 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CLDN18P56856 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN18P56856 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN18P56856 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN18P56856 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN18P56856 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN18P56856 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN18P56856 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN18P56856 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN18P56856 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN18P56856 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN18P56856 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN18P56856 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN18P56856 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN18P56856 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN18P56856 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN18P56856 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN18P56856 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN18P56856 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN18P56856 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN18P56856 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN18P56856 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN18P56856 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CLDN18P56856 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN18P56856 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN18P56856 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN18P56856 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CLDN18P56856 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms