Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
BRPF1P55201 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRPF1P55201 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms