Protein–RNA interactions for Protein: P54849

EMP1, Epithelial membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP1P54849 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EMP1P54849 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EMP1P54849 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EMP1P54849 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EMP1P54849 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EMP1P54849 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EMP1P54849 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EMP1P54849 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EMP1P54849 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EMP1P54849 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EMP1P54849 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EMP1P54849 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EMP1P54849 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EMP1P54849 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EMP1P54849 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EMP1P54849 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EMP1P54849 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EMP1P54849 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EMP1P54849 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EMP1P54849 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EMP1P54849 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EMP1P54849 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EMP1P54849 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EMP1P54849 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
EMP1P54849 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EMP1P54849 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EMP1P54849 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EMP1P54849 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EMP1P54849 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
EMP1P54849 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
EMP1P54849 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMP1P54849 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMP1P54849 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMP1P54849 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EMP1P54849 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMP1P54849 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMP1P54849 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMP1P54849 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMP1P54849 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMP1P54849 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMP1P54849 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMP1P54849 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMP1P54849 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMP1P54849 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMP1P54849 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMP1P54849 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMP1P54849 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMP1P54849 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EMP1P54849 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMP1P54849 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMP1P54849 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMP1P54849 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMP1P54849 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMP1P54849 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
EMP1P54849 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMP1P54849 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMP1P54849 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMP1P54849 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
EMP1P54849 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMP1P54849 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMP1P54849 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMP1P54849 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMP1P54849 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMP1P54849 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMP1P54849 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMP1P54849 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMP1P54849 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMP1P54849 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMP1P54849 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMP1P54849 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMP1P54849 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMP1P54849 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMP1P54849 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMP1P54849 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMP1P54849 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMP1P54849 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMP1P54849 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMP1P54849 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMP1P54849 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMP1P54849 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EMP1P54849 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMP1P54849 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMP1P54849 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMP1P54849 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMP1P54849 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMP1P54849 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMP1P54849 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMP1P54849 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMP1P54849 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EMP1P54849 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EMP1P54849 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EMP1P54849 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EMP1P54849 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EMP1P54849 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EMP1P54849 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EMP1P54849 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EMP1P54849 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EMP1P54849 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EMP1P54849 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EMP1P54849 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms