Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EPHB3P54753 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
EPHB3P54753 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
EPHB3P54753 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
EPHB3P54753 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EPHB3P54753 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EPHB3P54753 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
EPHB3P54753 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EPHB3P54753 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EPHB3P54753 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EPHB3P54753 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EPHB3P54753 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EPHB3P54753 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EPHB3P54753 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EPHB3P54753 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EPHB3P54753 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EPHB3P54753 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EPHB3P54753 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EPHB3P54753 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EPHB3P54753 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EPHB3P54753 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EPHB3P54753 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EPHB3P54753 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EPHB3P54753 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EPHB3P54753 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EPHB3P54753 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPHB3P54753 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPHB3P54753 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EPHB3P54753 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPHB3P54753 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPHB3P54753 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPHB3P54753 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPHB3P54753 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
EPHB3P54753 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EPHB3P54753 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
EPHB3P54753 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EPHB3P54753 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EPHB3P54753 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EPHB3P54753 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPHB3P54753 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EPHB3P54753 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPHB3P54753 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EPHB3P54753 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EPHB3P54753 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EPHB3P54753 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EPHB3P54753 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EPHB3P54753 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EPHB3P54753 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EPHB3P54753 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EPHB3P54753 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EPHB3P54753 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EPHB3P54753 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EPHB3P54753 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EPHB3P54753 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EPHB3P54753 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
EPHB3P54753 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EPHB3P54753 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EPHB3P54753 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EPHB3P54753 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EPHB3P54753 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
EPHB3P54753 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.3■■□□□ 1
EPHB3P54753 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms