Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
COPAP53621 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
COPAP53621 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
COPAP53621 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
COPAP53621 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COPAP53621 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COPAP53621 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COPAP53621 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COPAP53621 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COPAP53621 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
COPAP53621 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
COPAP53621 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
COPAP53621 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
COPAP53621 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
COPAP53621 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COPAP53621 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COPAP53621 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
COPAP53621 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
COPAP53621 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
COPAP53621 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
COPAP53621 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COPAP53621 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COPAP53621 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COPAP53621 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COPAP53621 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
COPAP53621 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COPAP53621 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
COPAP53621 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
COPAP53621 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COPAP53621 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COPAP53621 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COPAP53621 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COPAP53621 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COPAP53621 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COPAP53621 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COPAP53621 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COPAP53621 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COPAP53621 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COPAP53621 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COPAP53621 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COPAP53621 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COPAP53621 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COPAP53621 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COPAP53621 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COPAP53621 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COPAP53621 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
COPAP53621 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
COPAP53621 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COPAP53621 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COPAP53621 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COPAP53621 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
COPAP53621 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COPAP53621 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COPAP53621 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
COPAP53621 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COPAP53621 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
COPAP53621 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
COPAP53621 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
COPAP53621 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COPAP53621 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COPAP53621 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COPAP53621 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COPAP53621 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COPAP53621 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COPAP53621 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COPAP53621 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
COPAP53621 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPAP53621 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPAP53621 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPAP53621 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPAP53621 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPAP53621 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPAP53621 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPAP53621 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPAP53621 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPAP53621 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPAP53621 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPAP53621 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPAP53621 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPAP53621 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPAP53621 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPAP53621 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPAP53621 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPAP53621 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPAP53621 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPAP53621 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPAP53621 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPAP53621 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
COPAP53621 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COPAP53621 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COPAP53621 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COPAP53621 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COPAP53621 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COPAP53621 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COPAP53621 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COPAP53621 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COPAP53621 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
COPAP53621 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
COPAP53621 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
COPAP53621 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms