Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
EFNA3P52797 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFNA3P52797 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFNA3P52797 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFNA3P52797 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFNA3P52797 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFNA3P52797 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFNA3P52797 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFNA3P52797 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
EFNA3P52797 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
EFNA3P52797 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFNA3P52797 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFNA3P52797 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
EFNA3P52797 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFNA3P52797 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFNA3P52797 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFNA3P52797 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFNA3P52797 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFNA3P52797 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFNA3P52797 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFNA3P52797 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFNA3P52797 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFNA3P52797 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFNA3P52797 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFNA3P52797 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFNA3P52797 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFNA3P52797 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EFNA3P52797 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFNA3P52797 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFNA3P52797 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFNA3P52797 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFNA3P52797 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFNA3P52797 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFNA3P52797 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFNA3P52797 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFNA3P52797 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFNA3P52797 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFNA3P52797 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFNA3P52797 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFNA3P52797 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFNA3P52797 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
EFNA3P52797 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
EFNA3P52797 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFNA3P52797 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFNA3P52797 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFNA3P52797 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFNA3P52797 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFNA3P52797 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFNA3P52797 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFNA3P52797 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFNA3P52797 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
EFNA3P52797 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFNA3P52797 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EFNA3P52797 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFNA3P52797 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFNA3P52797 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFNA3P52797 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFNA3P52797 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFNA3P52797 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFNA3P52797 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFNA3P52797 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFNA3P52797 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFNA3P52797 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFNA3P52797 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFNA3P52797 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFNA3P52797 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFNA3P52797 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
EFNA3P52797 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFNA3P52797 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EFNA3P52797 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms