Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
SMARCA2P51531 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
SMARCA2P51531 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
SMARCA2P51531 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
SMARCA2P51531 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
SMARCA2P51531 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
SMARCA2P51531 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
SMARCA2P51531 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
SMARCA2P51531 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
SMARCA2P51531 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
SMARCA2P51531 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
SMARCA2P51531 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
SMARCA2P51531 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
SMARCA2P51531 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.45
SMARCA2P51531 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC36.57■■■■□ 3.45
SMARCA2P51531 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
SMARCA2P51531 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
SMARCA2P51531 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.45
SMARCA2P51531 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
SMARCA2P51531 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
SMARCA2P51531 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
SMARCA2P51531 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
SMARCA2P51531 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
SMARCA2P51531 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
SMARCA2P51531 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
SMARCA2P51531 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
SMARCA2P51531 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
SMARCA2P51531 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
SMARCA2P51531 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
SMARCA2P51531 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
SMARCA2P51531 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
SMARCA2P51531 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
SMARCA2P51531 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
SMARCA2P51531 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
SMARCA2P51531 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
SMARCA2P51531 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
SMARCA2P51531 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
SMARCA2P51531 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
SMARCA2P51531 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
SMARCA2P51531 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
SMARCA2P51531 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
SMARCA2P51531 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
SMARCA2P51531 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
SMARCA2P51531 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
SMARCA2P51531 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
SMARCA2P51531 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
SMARCA2P51531 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
SMARCA2P51531 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
SMARCA2P51531 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
SMARCA2P51531 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
SMARCA2P51531 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
SMARCA2P51531 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
SMARCA2P51531 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
SMARCA2P51531 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
SMARCA2P51531 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
SMARCA2P51531 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
SMARCA2P51531 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
SMARCA2P51531 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
SMARCA2P51531 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
SMARCA2P51531 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
SMARCA2P51531 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
SMARCA2P51531 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
SMARCA2P51531 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
SMARCA2P51531 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
SMARCA2P51531 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
SMARCA2P51531 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
SMARCA2P51531 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
SMARCA2P51531 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
SMARCA2P51531 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
SMARCA2P51531 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
SMARCA2P51531 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
SMARCA2P51531 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
SMARCA2P51531 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
SMARCA2P51531 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
SMARCA2P51531 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
SMARCA2P51531 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
SMARCA2P51531 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
SMARCA2P51531 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
SMARCA2P51531 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
SMARCA2P51531 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
SMARCA2P51531 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
SMARCA2P51531 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
SMARCA2P51531 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
SMARCA2P51531 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
SMARCA2P51531 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
SMARCA2P51531 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
SMARCA2P51531 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
SMARCA2P51531 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
SMARCA2P51531 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
SMARCA2P51531 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
SMARCA2P51531 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
SMARCA2P51531 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
SMARCA2P51531 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
SMARCA2P51531 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
SMARCA2P51531 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
SMARCA2P51531 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
SMARCA2P51531 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC36.48■■■■□ 3.43
SMARCA2P51531 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
SMARCA2P51531 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
SMARCA2P51531 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms