Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MRE11P49959 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MRE11P49959 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MRE11P49959 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MRE11P49959 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MRE11P49959 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MRE11P49959 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MRE11P49959 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MRE11P49959 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MRE11P49959 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MRE11P49959 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MRE11P49959 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MRE11P49959 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MRE11P49959 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MRE11P49959 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MRE11P49959 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRE11P49959 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRE11P49959 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRE11P49959 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRE11P49959 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRE11P49959 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRE11P49959 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRE11P49959 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRE11P49959 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRE11P49959 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRE11P49959 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRE11P49959 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRE11P49959 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRE11P49959 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRE11P49959 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRE11P49959 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRE11P49959 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRE11P49959 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRE11P49959 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MRE11P49959 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MRE11P49959 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MRE11P49959 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MRE11P49959 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MRE11P49959 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MRE11P49959 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MRE11P49959 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MRE11P49959 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MRE11P49959 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MRE11P49959 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MRE11P49959 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MRE11P49959 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MRE11P49959 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MRE11P49959 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MRE11P49959 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MRE11P49959 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MRE11P49959 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MRE11P49959 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MRE11P49959 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRE11P49959 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRE11P49959 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRE11P49959 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRE11P49959 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRE11P49959 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRE11P49959 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRE11P49959 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRE11P49959 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRE11P49959 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRE11P49959 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MRE11P49959 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MRE11P49959 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MRE11P49959 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MRE11P49959 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MRE11P49959 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MRE11P49959 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MRE11P49959 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MRE11P49959 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MRE11P49959 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MRE11P49959 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MRE11P49959 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MRE11P49959 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MRE11P49959 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MRE11P49959 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MRE11P49959 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MRE11P49959 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MRE11P49959 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MRE11P49959 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MRE11P49959 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MRE11P49959 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MRE11P49959 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MRE11P49959 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MRE11P49959 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MRE11P49959 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MRE11P49959 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MRE11P49959 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MRE11P49959 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MRE11P49959 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MRE11P49959 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MRE11P49959 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MRE11P49959 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MRE11P49959 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MRE11P49959 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MRE11P49959 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MRE11P49959 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MRE11P49959 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MRE11P49959 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms