Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCLMP48507 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCLMP48507 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCLMP48507 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCLMP48507 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCLMP48507 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCLMP48507 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCLMP48507 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GCLMP48507 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GCLMP48507 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCLMP48507 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCLMP48507 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCLMP48507 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCLMP48507 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCLMP48507 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GCLMP48507 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GCLMP48507 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCLMP48507 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCLMP48507 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCLMP48507 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCLMP48507 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCLMP48507 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GCLMP48507 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GCLMP48507 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GCLMP48507 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GCLMP48507 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GCLMP48507 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GCLMP48507 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCLMP48507 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCLMP48507 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCLMP48507 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCLMP48507 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCLMP48507 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCLMP48507 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCLMP48507 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCLMP48507 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GCLMP48507 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCLMP48507 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCLMP48507 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCLMP48507 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCLMP48507 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCLMP48507 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCLMP48507 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCLMP48507 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCLMP48507 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCLMP48507 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GCLMP48507 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCLMP48507 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCLMP48507 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCLMP48507 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCLMP48507 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCLMP48507 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCLMP48507 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCLMP48507 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCLMP48507 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCLMP48507 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GCLMP48507 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCLMP48507 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCLMP48507 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GCLMP48507 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCLMP48507 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCLMP48507 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCLMP48507 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCLMP48507 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCLMP48507 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCLMP48507 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCLMP48507 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCLMP48507 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCLMP48507 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCLMP48507 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCLMP48507 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCLMP48507 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GCLMP48507 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCLMP48507 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCLMP48507 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCLMP48507 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCLMP48507 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCLMP48507 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCLMP48507 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCLMP48507 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCLMP48507 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCLMP48507 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCLMP48507 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCLMP48507 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCLMP48507 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCLMP48507 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCLMP48507 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCLMP48507 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCLMP48507 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCLMP48507 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCLMP48507 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCLMP48507 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCLMP48507 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCLMP48507 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCLMP48507 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCLMP48507 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCLMP48507 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCLMP48507 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GCLMP48507 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCLMP48507 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms