Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC1A1P43005 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC1A1P43005 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLC1A1P43005 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC1A1P43005 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC1A1P43005 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC1A1P43005 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC1A1P43005 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLC1A1P43005 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC1A1P43005 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC1A1P43005 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC1A1P43005 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC1A1P43005 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC1A1P43005 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC1A1P43005 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC1A1P43005 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC1A1P43005 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC1A1P43005 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC1A1P43005 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC1A1P43005 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC1A1P43005 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC1A1P43005 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC1A1P43005 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC1A1P43005 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC1A1P43005 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC1A1P43005 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC1A1P43005 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC1A1P43005 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC1A1P43005 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC1A1P43005 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC1A1P43005 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC1A1P43005 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC1A1P43005 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC1A1P43005 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC1A1P43005 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC1A1P43005 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC1A1P43005 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC1A1P43005 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC1A1P43005 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC1A1P43005 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC1A1P43005 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC1A1P43005 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC1A1P43005 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC1A1P43005 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC1A1P43005 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC1A1P43005 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC1A1P43005 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC1A1P43005 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC1A1P43005 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC1A1P43005 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC1A1P43005 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC1A1P43005 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC1A1P43005 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC1A1P43005 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC1A1P43005 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC1A1P43005 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC1A1P43005 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC1A1P43005 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC1A1P43005 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC1A1P43005 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC1A1P43005 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC1A1P43005 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC1A1P43005 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC1A1P43005 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC1A1P43005 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC1A1P43005 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC1A1P43005 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC1A1P43005 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC1A1P43005 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC1A1P43005 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC1A1P43005 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC1A1P43005 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC1A1P43005 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC1A1P43005 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC1A1P43005 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC1A1P43005 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC1A1P43005 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC1A1P43005 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC1A1P43005 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC1A1P43005 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC1A1P43005 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC1A1P43005 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC1A1P43005 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC1A1P43005 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SLC1A1P43005 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC1A1P43005 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC1A1P43005 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC1A1P43005 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC1A1P43005 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC1A1P43005 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC1A1P43005 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SLC1A1P43005 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC1A1P43005 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC1A1P43005 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC1A1P43005 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC1A1P43005 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC1A1P43005 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC1A1P43005 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC1A1P43005 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC1A1P43005 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms