Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP6P35125 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP6P35125 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP6P35125 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP6P35125 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP6P35125 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP6P35125 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP6P35125 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP6P35125 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP6P35125 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP6P35125 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP6P35125 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP6P35125 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP6P35125 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP6P35125 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP6P35125 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP6P35125 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP6P35125 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP6P35125 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP6P35125 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP6P35125 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP6P35125 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP6P35125 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP6P35125 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
USP6P35125 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP6P35125 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP6P35125 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP6P35125 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP6P35125 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP6P35125 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP6P35125 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP6P35125 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP6P35125 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
USP6P35125 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP6P35125 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP6P35125 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP6P35125 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
USP6P35125 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP6P35125 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP6P35125 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP6P35125 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP6P35125 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP6P35125 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP6P35125 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
USP6P35125 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP6P35125 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP6P35125 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP6P35125 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP6P35125 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP6P35125 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP6P35125 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
USP6P35125 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP6P35125 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP6P35125 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
USP6P35125 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP6P35125 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP6P35125 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP6P35125 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
USP6P35125 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP6P35125 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP6P35125 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP6P35125 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
USP6P35125 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
USP6P35125 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP6P35125 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP6P35125 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP6P35125 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP6P35125 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP6P35125 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
USP6P35125 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP6P35125 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP6P35125 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP6P35125 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP6P35125 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP6P35125 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP6P35125 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
USP6P35125 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP6P35125 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP6P35125 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
USP6P35125 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP6P35125 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
USP6P35125 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP6P35125 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP6P35125 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
USP6P35125 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP6P35125 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
USP6P35125 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
USP6P35125 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
USP6P35125 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
USP6P35125 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
USP6P35125 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
USP6P35125 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
USP6P35125 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP6P35125 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP6P35125 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP6P35125 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP6P35125 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP6P35125 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP6P35125 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP6P35125 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms