Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 AC104123.1-203ENST00000513158 575 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD11P31277 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOXD11P31277 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.33■■□□□ 1
HOXD11P31277 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD11P31277 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD11P31277 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD11P31277 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD11P31277 MED20-203ENST00000409060 815 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD11P31277 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD11P31277 LBX1-AS1-202ENST00000434878 418 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD11P31277 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD11P31277 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HOXD11P31277 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD11P31277 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD11P31277 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HOXD11P31277 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD11P31277 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD11P31277 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD11P31277 AC090527.1-201ENST00000557965 431 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD11P31277 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD11P31277 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HOXD11P31277 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HOXD11P31277 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD11P31277 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD11P31277 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD11P31277 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD11P31277 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD11P31277 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD11P31277 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD11P31277 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD11P31277 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HOXD11P31277 AC096732.1-201ENST00000439565 477 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD11P31277 AL731577.1-201ENST00000449984 830 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD11P31277 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD11P31277 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD11P31277 AC124947.1-201ENST00000552835 814 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD11P31277 MEG8-208ENST00000553465 1176 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD11P31277 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD11P31277 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD11P31277 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HOXD11P31277 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD11P31277 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HOXD11P31277 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD11P31277 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD11P31277 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD11P31277 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD11P31277 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD11P31277 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD11P31277 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD11P31277 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD11P31277 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD11P31277 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD11P31277 OR4C5-201ENST00000319813 981 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD11P31277 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD11P31277 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD11P31277 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD11P31277 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD11P31277 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HOXD11P31277 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD11P31277 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD11P31277 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD11P31277 AC068987.2-201ENST00000565518 896 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HOXD11P31277 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD11P31277 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD11P31277 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD11P31277 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD11P31277 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD11P31277 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD11P31277 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD11P31277 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD11P31277 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD11P31277 RPS14P4-201ENST00000415880 418 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HOXD11P31277 AL513285.1-201ENST00000423187 432 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD11P31277 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD11P31277 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD11P31277 AC096759.2-202ENST00000515230 777 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD11P31277 RN7SL819P-201ENST00000581896 270 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HOXD11P31277 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HOXD11P31277 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD11P31277 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD11P31277 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD11P31277 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD11P31277 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD11P31277 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD11P31277 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD11P31277 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD11P31277 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD11P31277 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD11P31277 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD11P31277 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105 ms