Protein–RNA interactions for Protein: P13501

CCL5, C-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL5P13501 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCL5P13501 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCL5P13501 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCL5P13501 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCL5P13501 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCL5P13501 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCL5P13501 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCL5P13501 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCL5P13501 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCL5P13501 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCL5P13501 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCL5P13501 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCL5P13501 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCL5P13501 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCL5P13501 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL5P13501 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL5P13501 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL5P13501 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL5P13501 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL5P13501 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL5P13501 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL5P13501 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL5P13501 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL5P13501 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL5P13501 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL5P13501 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL5P13501 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL5P13501 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL5P13501 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL5P13501 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL5P13501 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL5P13501 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL5P13501 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL5P13501 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL5P13501 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL5P13501 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL5P13501 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCL5P13501 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCL5P13501 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCL5P13501 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCL5P13501 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCL5P13501 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCL5P13501 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCL5P13501 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCL5P13501 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCL5P13501 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCL5P13501 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCL5P13501 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCL5P13501 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCL5P13501 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCL5P13501 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL5P13501 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL5P13501 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL5P13501 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL5P13501 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL5P13501 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL5P13501 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL5P13501 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL5P13501 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL5P13501 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL5P13501 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL5P13501 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCL5P13501 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCL5P13501 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCL5P13501 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCL5P13501 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCL5P13501 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCL5P13501 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCL5P13501 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCL5P13501 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCL5P13501 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCL5P13501 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCL5P13501 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCL5P13501 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCL5P13501 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCL5P13501 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL5P13501 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL5P13501 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL5P13501 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL5P13501 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL5P13501 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL5P13501 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL5P13501 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL5P13501 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL5P13501 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL5P13501 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL5P13501 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL5P13501 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL5P13501 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL5P13501 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL5P13501 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL5P13501 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL5P13501 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL5P13501 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL5P13501 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCL5P13501 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCL5P13501 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCL5P13501 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCL5P13501 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCL5P13501 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms