Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DEFA4P12838 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms