Protein–RNA interactions for Protein: P09496

CLTA, Clathrin light chain A, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTAP09496 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CLTAP09496 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CLTAP09496 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CLTAP09496 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLTAP09496 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLTAP09496 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLTAP09496 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLTAP09496 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLTAP09496 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLTAP09496 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLTAP09496 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLTAP09496 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLTAP09496 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLTAP09496 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLTAP09496 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLTAP09496 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLTAP09496 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLTAP09496 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLTAP09496 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLTAP09496 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLTAP09496 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLTAP09496 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLTAP09496 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLTAP09496 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLTAP09496 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CLTAP09496 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CLTAP09496 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLTAP09496 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CLTAP09496 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLTAP09496 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CLTAP09496 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLTAP09496 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLTAP09496 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLTAP09496 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLTAP09496 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLTAP09496 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLTAP09496 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLTAP09496 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLTAP09496 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLTAP09496 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CLTAP09496 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLTAP09496 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLTAP09496 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLTAP09496 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLTAP09496 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLTAP09496 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLTAP09496 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLTAP09496 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLTAP09496 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLTAP09496 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLTAP09496 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLTAP09496 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLTAP09496 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLTAP09496 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLTAP09496 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLTAP09496 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLTAP09496 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLTAP09496 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLTAP09496 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLTAP09496 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLTAP09496 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CLTAP09496 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLTAP09496 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLTAP09496 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLTAP09496 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLTAP09496 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CLTAP09496 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLTAP09496 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLTAP09496 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLTAP09496 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLTAP09496 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLTAP09496 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLTAP09496 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLTAP09496 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CLTAP09496 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLTAP09496 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLTAP09496 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLTAP09496 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLTAP09496 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLTAP09496 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLTAP09496 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLTAP09496 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLTAP09496 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLTAP09496 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLTAP09496 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLTAP09496 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLTAP09496 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLTAP09496 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLTAP09496 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLTAP09496 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLTAP09496 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CLTAP09496 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CLTAP09496 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CLTAP09496 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLTAP09496 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLTAP09496 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLTAP09496 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLTAP09496 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLTAP09496 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLTAP09496 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms