Protein–RNA interactions for Protein: O60393

NOBOX, Homeobox protein NOBOX, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOBOXO60393 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NOBOXO60393 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms