Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EXTL3O43909 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EXTL3O43909 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms