Protein–RNA interactions for Protein: O15534

PER1, Period circadian protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PER1O15534 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PER1O15534 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PER1O15534 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PER1O15534 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PER1O15534 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PER1O15534 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PER1O15534 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PER1O15534 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PER1O15534 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PER1O15534 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PER1O15534 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PER1O15534 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PER1O15534 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PER1O15534 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PER1O15534 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PER1O15534 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PER1O15534 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PER1O15534 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PER1O15534 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PER1O15534 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PER1O15534 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PER1O15534 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PER1O15534 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PER1O15534 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PER1O15534 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PER1O15534 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PER1O15534 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PER1O15534 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PER1O15534 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PER1O15534 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PER1O15534 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PER1O15534 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PER1O15534 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PER1O15534 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PER1O15534 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PER1O15534 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PER1O15534 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PER1O15534 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PER1O15534 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PER1O15534 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PER1O15534 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PER1O15534 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PER1O15534 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PER1O15534 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PER1O15534 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PER1O15534 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PER1O15534 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PER1O15534 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PER1O15534 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PER1O15534 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PER1O15534 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PER1O15534 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PER1O15534 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PER1O15534 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PER1O15534 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PER1O15534 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PER1O15534 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PER1O15534 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PER1O15534 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PER1O15534 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PER1O15534 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PER1O15534 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PER1O15534 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PER1O15534 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PER1O15534 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PER1O15534 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PER1O15534 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PER1O15534 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PER1O15534 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PER1O15534 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PER1O15534 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PER1O15534 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PER1O15534 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PER1O15534 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PER1O15534 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PER1O15534 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PER1O15534 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PER1O15534 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PER1O15534 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PER1O15534 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PER1O15534 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PER1O15534 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PER1O15534 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PER1O15534 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PER1O15534 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PER1O15534 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PER1O15534 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PER1O15534 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PER1O15534 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PER1O15534 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PER1O15534 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PER1O15534 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PER1O15534 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PER1O15534 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PER1O15534 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PER1O15534 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PER1O15534 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PER1O15534 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PER1O15534 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PER1O15534 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms