Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PIK3CDO00329 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIK3CDO00329 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.6 ms