Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NFKBIEO00221 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NFKBIEO00221 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NFKBIEO00221 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms