Protein–RNA interactions for Protein: H7C1W4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1W4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
H7C1W4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
H7C1W4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
H7C1W4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
H7C1W4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
H7C1W4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
H7C1W4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
H7C1W4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
H7C1W4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
H7C1W4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
H7C1W4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
H7C1W4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
H7C1W4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
H7C1W4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
H7C1W4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
H7C1W4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
H7C1W4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
H7C1W4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
H7C1W4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
H7C1W4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
H7C1W4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
H7C1W4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
H7C1W4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
H7C1W4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
H7C1W4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
H7C1W4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
H7C1W4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
H7C1W4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
H7C1W4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
H7C1W4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
H7C1W4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
H7C1W4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
H7C1W4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
H7C1W4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
H7C1W4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
H7C1W4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
H7C1W4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
H7C1W4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
H7C1W4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
H7C1W4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
H7C1W4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
H7C1W4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
H7C1W4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
H7C1W4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
H7C1W4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
H7C1W4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
H7C1W4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
H7C1W4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
H7C1W4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
H7C1W4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
H7C1W4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
H7C1W4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
H7C1W4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
H7C1W4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
H7C1W4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
H7C1W4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
H7C1W4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
H7C1W4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
H7C1W4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
H7C1W4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
H7C1W4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
H7C1W4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
H7C1W4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
H7C1W4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
H7C1W4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
H7C1W4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
H7C1W4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
H7C1W4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
H7C1W4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
H7C1W4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
H7C1W4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
H7C1W4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
H7C1W4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
H7C1W4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
H7C1W4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
H7C1W4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
H7C1W4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
H7C1W4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
H7C1W4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
H7C1W4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
H7C1W4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
H7C1W4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
H7C1W4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
H7C1W4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
H7C1W4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
H7C1W4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
H7C1W4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
H7C1W4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
H7C1W4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
H7C1W4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
H7C1W4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
H7C1W4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
H7C1W4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
H7C1W4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
H7C1W4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
H7C1W4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
H7C1W4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
H7C1W4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
H7C1W4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
H7C1W4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms