Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP17L12C9JPN9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
USP17L12C9JPN9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms