Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HHLA1C9JL84 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HHLA1C9JL84 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms