Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL33A6NCF5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms