Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FRMD3A2A2Y4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FRMD3A2A2Y4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms