Protein–RNA interactions for Protein: P43088

PTGFR, Prostaglandin F2-alpha receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRP43088 RRM2-201ENST00000304567 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 SPHKAP-202ENST00000392056 6917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 UGT2B4-206ENST00000512583 1836 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 TMEM135-202ENST00000340353 3938 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 SMG7-202ENST00000367537 5970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 PSMC1P10-201ENST00000434820 1327 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 KAT7-201ENST00000259021 9644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 PRICKLE2-201ENST00000295902 7918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 RXFP2-202ENST00000380314 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 PDPR-210ENST00000568530 7223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 CCR9-203ENST00000395963 2512 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 KIAA1324L-203ENST00000416314 3179 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 FAM168A-201ENST00000064778 7296 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 TP63-204ENST00000392460 1668 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 OR4Q2-201ENST00000541415 2778 ntAPPRIS P5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 ARMC8-210ENST00000469044 4790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 AC128688.2-201ENST00000563632 1937 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 CLIC5-201ENST00000185206 6023 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 HEATR9-204ENST00000603870 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 ATG2B-202ENST00000359933 13684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 GNRHR2-202ENST00000361928 1035 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 TDRKH-AS1-201ENST00000389897 992 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 IGLV3-25-201ENST00000390305 380 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 NDUFA3-202ENST00000391762 435 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 OR2A12-201ENST00000408949 1046 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 GEMIN6-203ENST00000409566 834 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 RN7SKP139-201ENST00000410411 293 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 AL023773.2-201ENST00000412173 1005 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 LINC00525-201ENST00000412730 1188 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 RPSAP21-201ENST00000414293 885 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 CDC42-IT1-201ENST00000431803 692 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 TCAIM-208ENST00000444602 1056 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 LINC01231-201ENST00000452746 886 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 SETP4-201ENST00000455717 868 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 RN7SL211P-201ENST00000485246 276 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 TAGLN2P1-201ENST00000524097 587 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 AP000781.1-201ENST00000534162 311 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 CACNA1C-AS2-201ENST00000545526 609 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 ENSAP2-201ENST00000554405 352 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 AL357093.1-201ENST00000556926 458 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 AC092718.2-203ENST00000561808 789 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 RN7SL731P-201ENST00000584329 293 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 MIR6785-201ENST00000618984 81 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 AP000769.1-201ENST00000619960 844 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 LINC01132-202ENST00000641214 1085 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 STRADA-233ENST00000638888 1718 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 AC107959.2-201ENST00000501897 2636 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 ELP3-219ENST00000537665 3053 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 TULP4-202ENST00000367097 11295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 AC135012.3-201ENST00000599841 4039 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 SLC15A1-202ENST00000376503 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 KIAA0100-201ENST00000389003 6852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 CDH17-202ENST00000441892 2204 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 SNX27-201ENST00000368838 1308 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 AC133561.2-202ENST00000561642 1301 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 AL590999.1-201ENST00000607675 3776 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 PLEKHG4B-204ENST00000637938 12612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 FAM205BP-202ENST00000399773 4009 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 GUCY1A3-202ENST00000393832 4286 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 PARP4-201ENST00000381989 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 PTPRK-206ENST00000368215 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 OR2T10-202ENST00000642090 3519 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 AC012158.1-203ENST00000488306 1352 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 AC023050.4-201ENST00000538830 1380 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 CXCR6-201ENST00000304552 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 JADE1-202ENST00000413543 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 AL162632.3-201ENST00000566976 1625 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 ITPRIPL1-201ENST00000361124 4295 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 TROVE2-205ENST00000367446 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 OR51D1-202ENST00000641817 3561 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 DEFA5-201ENST00000330590 449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 BPIFA3-202ENST00000375454 1116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 Metazoa_SRP.7-201ENST00000392674 281 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 MED28P1-201ENST00000399158 571 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 AGR2-201ENST00000401412 782 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 STPG3-202ENST00000412566 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 MAGEA13P-201ENST00000418272 951 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 DUTP8-201ENST00000418412 489 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 AL157895.1-203ENST00000423551 708 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 AC104170.1-202ENST00000426017 362 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 LINC00112-201ENST00000432830 522 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 AC073188.1-201ENST00000442493 361 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 AC073626.2-201ENST00000449443 316 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 AC006455.3-201ENST00000454641 333 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 AC108114.1-201ENST00000477321 437 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 IGHVII-1-1-201ENST00000517907 180 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 AC091946.1-201ENST00000522350 852 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 ASPH-225ENST00000522835 1258 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 TRIQK-220ENST00000524037 865 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 KCTD21-AS1-205ENST00000530261 910 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 KLF5-205ENST00000539231 2951 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 AC063947.2-201ENST00000547000 1256 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 C14orf166-206ENST00000556760 851 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 AC087481.1-201ENST00000561684 965 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 AC009120.2-203ENST00000565313 539 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 AC005381.1-204ENST00000585697 599 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 AL354872.2-201ENST00000607679 466 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 Metazoa_SRP.140-201ENST00000613842 252 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 STPG3-205ENST00000620243 1025 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
PTGFRP43088 RN7SL575P-201ENST00000620774 299 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
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