Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NRXN3Q9Y4C0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NRXN3Q9Y4C0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NRXN3Q9Y4C0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NRXN3Q9Y4C0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NRXN3Q9Y4C0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NRXN3Q9Y4C0 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NRXN3Q9Y4C0 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NRXN3Q9Y4C0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NRXN3Q9Y4C0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
NRXN3Q9Y4C0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NRXN3Q9Y4C0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NRXN3Q9Y4C0 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NRXN3Q9Y4C0 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NRXN3Q9Y4C0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NRXN3Q9Y4C0 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NRXN3Q9Y4C0 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NRXN3Q9Y4C0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NRXN3Q9Y4C0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NRXN3Q9Y4C0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NRXN3Q9Y4C0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NRXN3Q9Y4C0 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
NRXN3Q9Y4C0 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
NRXN3Q9Y4C0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NRXN3Q9Y4C0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
NRXN3Q9Y4C0 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NRXN3Q9Y4C0 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NRXN3Q9Y4C0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NRXN3Q9Y4C0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NRXN3Q9Y4C0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NRXN3Q9Y4C0 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NRXN3Q9Y4C0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NRXN3Q9Y4C0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NRXN3Q9Y4C0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NRXN3Q9Y4C0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NRXN3Q9Y4C0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NRXN3Q9Y4C0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
NRXN3Q9Y4C0 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NRXN3Q9Y4C0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NRXN3Q9Y4C0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NRXN3Q9Y4C0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NRXN3Q9Y4C0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NRXN3Q9Y4C0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NRXN3Q9Y4C0 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NRXN3Q9Y4C0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NRXN3Q9Y4C0 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NRXN3Q9Y4C0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NRXN3Q9Y4C0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NRXN3Q9Y4C0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NRXN3Q9Y4C0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NRXN3Q9Y4C0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NRXN3Q9Y4C0 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NRXN3Q9Y4C0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NRXN3Q9Y4C0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
NRXN3Q9Y4C0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NRXN3Q9Y4C0 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NRXN3Q9Y4C0 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NRXN3Q9Y4C0 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NRXN3Q9Y4C0 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NRXN3Q9Y4C0 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
NRXN3Q9Y4C0 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
NRXN3Q9Y4C0 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NRXN3Q9Y4C0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NRXN3Q9Y4C0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NRXN3Q9Y4C0 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
NRXN3Q9Y4C0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NRXN3Q9Y4C0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms