Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I6

NINL, Ninein-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINLQ9Y2I6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
NINLQ9Y2I6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NINLQ9Y2I6 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms