Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
HDAC5Q9UQL6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HDAC5Q9UQL6 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms