Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGA11Q9UKX5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA11Q9UKX5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms