Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY4

DNAJB4, DnaJ homolog subfamily B member 4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB4Q9UDY4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAJB4Q9UDY4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DNAJB4Q9UDY4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms