Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KLHL9Q9P2J3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms