Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FANCLQ9NW38 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FANCLQ9NW38 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms