Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV31

IMP3, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP3Q9NV31 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
IMP3Q9NV31 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
IMP3Q9NV31 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms