Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX4

PHPT1, 14 kDa phosphohistidine phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHPT1Q9NRX4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PHPT1Q9NRX4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PHPT1Q9NRX4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms