Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
INCENPQ9NQS7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms