Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RAB18Q9NP72 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RAB18Q9NP72 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms