Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCN3

TMEM8A, Post-GPI attachment to proteins factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM8AQ9HCN3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM8AQ9HCN3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMEM8AQ9HCN3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMEM8AQ9HCN3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMEM8AQ9HCN3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMEM8AQ9HCN3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMEM8AQ9HCN3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM8AQ9HCN3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM8AQ9HCN3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM8AQ9HCN3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM8AQ9HCN3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM8AQ9HCN3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM8AQ9HCN3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM8AQ9HCN3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM8AQ9HCN3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM8AQ9HCN3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM8AQ9HCN3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM8AQ9HCN3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM8AQ9HCN3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM8AQ9HCN3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM8AQ9HCN3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM8AQ9HCN3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM8AQ9HCN3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM8AQ9HCN3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM8AQ9HCN3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM8AQ9HCN3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM8AQ9HCN3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM8AQ9HCN3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TMEM8AQ9HCN3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM8AQ9HCN3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM8AQ9HCN3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM8AQ9HCN3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM8AQ9HCN3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM8AQ9HCN3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM8AQ9HCN3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM8AQ9HCN3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TMEM8AQ9HCN3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM8AQ9HCN3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM8AQ9HCN3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM8AQ9HCN3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM8AQ9HCN3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM8AQ9HCN3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM8AQ9HCN3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM8AQ9HCN3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms