Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDGFDQ9GZP0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDGFDQ9GZP0 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
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