Protein–RNA interactions for Protein: Q99928

GABRG3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRG3Q99928 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABRG3Q99928 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABRG3Q99928 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GABRG3Q99928 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABRG3Q99928 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABRG3Q99928 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABRG3Q99928 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABRG3Q99928 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABRG3Q99928 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABRG3Q99928 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GABRG3Q99928 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GABRG3Q99928 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABRG3Q99928 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GABRG3Q99928 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABRG3Q99928 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABRG3Q99928 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABRG3Q99928 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABRG3Q99928 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABRG3Q99928 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GABRG3Q99928 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABRG3Q99928 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms