Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC9Q96Q05 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC9Q96Q05 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms