Protein–RNA interactions for Protein: Q96KR7

PHACTR3, Phosphatase and actin regulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR3Q96KR7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PHACTR3Q96KR7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHACTR3Q96KR7 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms