Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EDC3Q96F86 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms