Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PGBD4Q96DM1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGBD4Q96DM1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms