Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
FAF2Q96CS3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms