Protein–RNA interactions for Protein: Q92845

KIFAP3, Kinesin-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFAP3Q92845 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KIFAP3Q92845 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KIFAP3Q92845 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms