Protein–RNA interactions for Protein: Q91XV3

Basp1, Brain acid soluble protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Basp1Q91XV3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Basp1Q91XV3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms